Действия игры начинаются спустя несколько месяцев после пожара в лаборатории. Мураки жив, кроме того, ему удалось каким-то образом спасти голову своего брата Саки, и теперь он жаждет мести. Ория и Укё тян выхаживали его все это время, пока его ненависть накапливалась, собственное бессилие разъедало его изнутри. Наконец пришло время отомстить шинигами с глазами цвета аметистов. Он полон сил, а его ненависть сильна как никогда раньше, ведь его едва не лишили основного в жизни - его цели.
Тем временем, сначала в Токио, а затем и в Нагасаки стали исчезать души. В списке мертвых появилось много имен тех, кому еще не судилось умереть, но их тела продолжали жить даже после того, как душа исчезала. Весь десятый департамент пришел в движение, любые ниточки, за которые удавалось ухватиться сотрудникам, обрывались.
В тоже время довольно известная фирма по производству автоматов с напитками и сладостями внедрила на улицы новые автоматы, с широким выбором и гораздо более удобных в обращении, чем предыдущая модель. Имеют ли эти события какую-то связь? И почему повелитель ада впервые за много лет явился в департамент?